故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中，校长是严肃又寡言的碇原度（立木文彦 配音）。作为校长的儿子，碇真嗣（绪方惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外，在原作中高大帅气的初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。 动画以《新世界福音战士》中的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛，描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。
演员：菅生隆之 小野大辅 铃村健一 桑岛法子 大塚芳忠 麦人 千叶繁 赤羽根健治 细谷佳正 久川绫 田中理惠 佐藤利奈 内田彩 平川大辅 长岛雄一 关俊彦 山寺宏一 若本规夫
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演员：福山润 野上尤加奈 樱井孝宏 名冢佳织 小清水亚美 白鸟哲 新井里美 千叶纱子 真殿光昭 桧山修之 皆川纯子 幸野善之 成田剑 后藤邑子 保志总一朗 井上伦宏 仓田雅世 三户耕三 黑泽朋世 高田裕司 渡边明乃 金井美香 折笠富美子 大原沙耶香 杉山纪彰 户田惠子 村瀬步 大塚明夫 岛崎信长 高木涉 津田健次郎
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演员：阪口大助 生天目仁美 松冈由贵 猪口有佳 中原麻衣 千叶千惠巳 辻谷耕史 鹰森淑乃 野田顺子 筱原惠美 古山贵实子 浅野真澄 下屋则子 渡边明乃 山口隆行 内藤玲 矢岛晶子 田中敦子 桑岛法子 冈村明美 小岛惠美 成田纱矢香 菊池正美 松本保典 梅津秀行 石井康嗣 大竹宏 田中完 永野广一 高阶俊嗣 下山吉光 川田绅司 志村知幸 传坂勉 浪川大辅 羽多野涉 柿原彻也 高桥良吉 冈崎雅纮 森训久
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